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COG category: RNA processing and modification
Number of genes found: 149
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# Dictyostelium discoideum AX4, AX4 >DDB_G0272997 DDB_G0272997, ATGGGTATTGAGGGATTAAATTTATTCATGGGTAAACAATTTGGTTGTGT TGAAAAAGTAAAAGAAATTACCACCGATCATGTATATATAGATTTAAATA ATTATTTACATAAATCAGTTAAAAGGGGAGATAATTCCAAATTAAATACA GAAGTAAATGTTTTTAGAATATTAAAATCTTTTATAGATGGAATTTTAAG AAAAGTTCGTGTTAAACATTCCGTATTCTTTGGTATTGATGGTCCTGGTC CTAGATCAAAAATGATATTACAAAGAGAAAGAAGATTAAAGAATGGGAAT ATAGATAAATTAAAATATTTTATAAATAGAAATAAAGAGCAACAACAACA GCAACAACAGCAACAACAACAATCACCTCAACTTCACGATTATGATTATT TAAATGAAAATGATTTAAAATCATTTGATAGCTCATTCTCAACATTAGAA TTCACACCAGGTACTACATTTATGGGTAAATTAAAAGATTTTTTAATATT TTATACAAAGAATAAATTATATTTTGCAAAAAAGATTTTTATTTCTGCAT CTGATAGAATTGGTGAAGGAGAATTTAAAATTTTCGAACAAATTTTAAAT TCAAATTATCCAATAAATGATTCATTTACAATAGTTTCAAGTGATTCAGA TATTTTATTATTTTCATTATTATCAAAATATAAAAATGTTTATATTTATA ATAAAGATTCTGAAGAAATTATTAAAATTGATAAAATTAGAGATAAAATT TATCAACAATGTTATAAAAAGAAACAAAAAAAACAAAAACAACAAAAAAA ATCAGGAGGAGAAGTGGAAGGAGAAGGTGAAGGAATAGCAACAGAGGAAA AAGAAGAAGGGGTGCAAATTGAAGAAGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAGGAA 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CCAAAGCGACAATTTTAACAGCAGATATAGGGCATGAAATTAGAGAAGTT TGGGCACATAATTTAGAATATGAAATGTCACTAATAAGAGAATTAGTTGA TATATATCCTTGTGTTGCAATTGACACAGAATTTCCAGGATTTGTAAATA AACCAATTGAATCAATGAGAATGTATCCAGATTATAATTATCAAACATTA AGATCAAATGTAGATTTATTAAAGATAATTCAATTTGGAATAACATTTTC AGATAGTACAGGTTGTTTGCCTGTACCAACATGTACATGGCAATTTAATT TCAAATTTAGTTTAAAAGATGATATGTATTCACCATACGCAATTGAGTTA TTAAAAAGTTGTGGAATTGATTTCCAAAGGATTGAAGACTATGGAATTGA TGTTAATGATTTTTCAGAATTATTCATTTCATCAGGTATTGTATTGAATG ATAAAATTCAATGGATTTGTTTTCATGGTGGTTACGATTTCGGTTATTTA TTAAAAGTTTTAAGTTGTTCAGAATTACCAAAATCTGAATCCGATTTTTT CGATCTCTTAAGAATTTACTTTCCATGTATATACGATGTAAAATATTTAA TGAAAAGTTGTAAAAATTTAAAAGGTGGTTTAAGTGGTTTAGCTGAAGAT TTAAATGTGGTCAGAGTCGGTCCTCAACATCAAGCAGGAAGTGATTCTTT ATTGACAAATTCAACATTTTTTAAATTAAGAGAGGAATTTTTTGAAAATG AAATTGATGATCATAAATATAAAGGAATTTTATATGGTTATAATGTCAGT CAAAATTTTCATCATAATGGTCATTTGTAA >DDB_G0285705 DDB_G0285705, contains a RING-finger that is a specialised type of Zn-finger domain which in some cases has been shown to be involved in ubiquitin E3 ligase activity contains 14 putative transmembrane domains ATGCAACAACAACAAAATCAAGAGGAGGAAGATTTTTGTAGGGTGTGTAG AAATGGTTCAACACCTGATAATCCATTATCATATCCATGCAAATGTAGTG GTTCCATCAAATACATTCACCAAAATTGTTTATTAGAGTGGATTCAACAT TCAAAAAGTTCTTCATGTGAGCTATGTGGCCATCCCTTTAGATTTACTCC AATTTATTCACCAAATGCACCAGAATTTATACCATCCCATGAATTATTTT ATGAAGCATTAATTAGGTTTAAGTGGTATATTAAAAAGATATCAAGAATA TTATATATTGTATTCTGTTGGTTATTTATTGTACCAACAGTAACATGTTG GATTTTTAATTTCTTTTTTGGTCAAAAATGGTTGGTACCTTTGGGAAGAG TGGTAATGGAGAATAGTGGATTCGGTAGTAGTCATCACACAGCAGTCACA CTATTTTATGACTTTTTCATTGGCACAACTTTATTCTTTTGGATCATTTT AGCATCAATTGCCAGTTATATGATCATCGATTTCATTCATCATAAACATG CTGAAATTGAAATTCAAGATGAATTCGAATTTGATAGTGATGATACTTAT TTACAAAATTTACAACAACCACAACAACAACAACAACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAC AACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTA CAACAACTACAACAACAACCACCACTACAACAACAAAATATAATACAACA AGCAGATAATAATAACAATACTACTAATGAAGAGAATGTTTATAATAATC AAGATTTAGGATTTCAAATTACTGATGATATGCCAATTAGGTTACGTCAA 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TTAATTTATGATTTTAGAATATCAACCTCAATCGAAGAGAAATTCCCACC ACCTCTGTCATTACCACCAGGTTATATCATTCGTCGAGAAAAACAAAGAT ATACATTTACAGAGGATCAATGGAAAATAGATTTAACTAAAGTTATTGTT AGACCAGATTTCAATGCTACAGTTGAACAAGAACTTTATGAAGTTGAAAT TGAATTATTCCCTGAAGCAATTCAAGCTTGTCAAGAAAAAACAAGTTTAA CTGAATTATTAAATGATTTTTTAAATGCTATTAAAGGATTAACAAATATA GTTAAAAATGGCGGAGAAACATCATTTCCAGAAATTTCATTAGATAAAGT TGGAAATGTTTCAGAATTTTATAGATTGAGAGATTTAGTATTTAAGTATA TTCCAAGTGCTCCACAAAGAAAAAATGATACATTTCCTGGTTCAATGCCT GTAAATTTTGGTAAGAAATATTTTATTCATGTTCAAAATAATGAATATTT TGTTAGTGATAAAACTGATGGTATAAGATATATGTTATTAATTGATCATA CTGGTTGTTATTTGGTTGATAGAAAATTTGATTTTTATCAAATTCAAGGT TTTGATATACTTGTAACATTATTTGGAGAAGGTACATTATTAGATGGTGA AATGGTTAGAAATTTACAAACTAAAAGAGCAAATTTTTTAATATTTGATG TTTTATCAGTAAAGAATGAATTACATCATCAAAAATTATTAAAAGATAGA TTAACAGAGATTGGTAATGTAGTTTCAACATTACGTTCAAATTTAAAGGT TGATACACCATTTGATATATTGGGTAAATCATTCCAACTTAAATCAAAGA TTGTAAATTTATTTAAAAATATTAAAGAATATCCAAATGGTGAAAGAGTT TATTCAGATGGGAAAAGATGTCACAATACTGATGGTATTATATTCACACC 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CTTATTCTTATATGACTCACCCACCAAGAGGTTACCATCCAAATGAAAAT CAATATCATTAA >DDB_G0285829 bxdc5, ortholog of S. cerevisiae RPF1 and H. sapiens BXDC5 a nucleolar protein involved in the assembly of the large ribosomal subunit ATGGTAAAACCAAAAAAAGAAGTTGATAAAGATGATTTAACAAAAGAAGA ATTAAAATTAAGAAGATCACCAACAGATATAAAATGTAAAGCCAAAAGGG TTTTATTAGTACAAAAACTTCAAGCAGCAAAGAAAACTGCAAGAGAAAAA GCAAGAAAACAAAGAAAGAAAGAAAGAGAGATATTAGGTGATGCAGCACC AGCCAAAGAAGTACCAAGAACCATTGAATCTATGAGAAGAGCTGATGAAA CCATTGTAGATACAGAGAATGATAAAGAATTTGAAGAAGAAATTAATAAG GATGAATTTGAATCCTATTTCGATGGTAGAGTACCAAAGATTGTAGTAAC CACAAATCAAAGATCAACTAAAGAAGCCGTTGAGTTTGCTCAAGTATTTA CTAAACTTTTACCAAATTGTGAATTCTTTCATCGTAGAAAATATCATTTA AAAGAAATCGTTCAATTTTGTAATAATAGAGATTATACTGATATTATTGT TGTAAATGAAACAAAAGGAATTATAGATGAATTAACAATTTCACATTTAC CAAATGGACCAACAGCAGTATTTAGATTAACAAATTTAGTTATGCCAGAG GATATACCAGGTGGTGGTGAAATGACATCACATAAAGCAGAATTAATTGT TAATAATTTTACAACACGTTTAGGTCATTCAATTGGTAGAATGTTTGCAT CAATGTTTGCACAAGATCCAAATTTTAAAGGTCGTAGAGTTTGTACACTT 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and polyadenylation steps of mRNA 3'-end maturation Mammalian CLP1 is a subunit of cleavage complex IIA which is required for cleavage but not for polyadenylation of pre-mRNA ATGTCAAATGATAATAGTGTAAATATTAATAATTTTTCAAGTATGAATGG TGGTGGTGGTGGTTCAGATATTCAATTTCCTTTAAAACCATCGCAACAAC AACAACAACAACAACAAAATTCTATAAATCAAAGTACAATTAGAACATTA GAGATTACACAAGAATTAAGATATGAGATTGATTTTGACCAAAATGGTTG GATGAAATTAATTGAAGGTACAGCAGAATGTTTTGGTACGGAATTATCAT TAAATAAAGTTTATAAATTGTCAGGTACAAAGGGTGCAGTTTTTACATGG ACAGGTTGCAAGATAGAGATAACTAATAATTGTCAACCTTATATTGGGGA GAAAACTCCAATGCCACAATACGCAGGAGTATATCAAGAATTGGATGCAT TTAGAGTTAGCATATTGGACGAACCAAAAAAGAGTGGTCCACGTGTTATA ATTGTCGGTCCTACCGATAGTGGGAAATCGTCACTCTCAAAGATACTTTT AGCCTACAGTGCCCGATCAGGCTATCAACCATTATTTGTTGATTTAGACC CTGGTCAAGGTTCAATCACCATACCAGGCACAATTTCAGCAGCACATATT CAAAATCCATTGGATATCGAGGAGGGGTTAGCTGGTGGGATTCCATTGGC TCATTTCTATGGTCACACTTCATTGGATGTGAATCCTGATCTCTTTAAAG CACTTTGTAAAAATTTAGCATCATTTATCGATAAACAATTAGACAGTTCA AACATTTCAAGAATCTCTGGTTTCATTGCAAATACTTGTGGTTGGATAGA TGGTTTAGGTTATAAAATACTCTTACAAAATATTGATGTCTTTAAAGCAA ACTTAATCATTGTTATGGATAATGAAAAACTTTATAGTGATATCAGTTCT CATTATTCTCAAAAAGATAATTCAATTAAAATTATAAAATTACCAAAATC TGGTGGTGTATTTATAAGACCACCAGTATTTAGAAAAAAAACAAGAATGA ATAGAATAAAAGAATATTTTAATGGTATAAACGATAATTTATCACCACAT TATATAGTATTAGATTTTAAAGATGTTAGTATTTATAGAACTGGTGGTGG TCCTGCTGCACCAGCTTCAGCATTACCAATTGGTACTTCATCTCAAATTG ATCCACTTCAAATCACTGAAGTTTATCCTAGTTTAGATATGTGTCATTCA ATATTTGCAATCTCTTATGCAAAACAAGCTTCAAATATTTTTCATTCAAA TGTTGCTGGTTTCCTTTATGTTTCTGATATCGATATGGAAACAAAGAAAA TTACAGTTATTTCACCAGCACCGGGTCCACTTCCTTCAAGATTTTTACTT TTAGGCACATTAAAATGGATGGAAAATTAA >DDB_G0281585 cpsf1, ortholog of the human CPSF1 and yeast YTH1 the 160 kDa subunit of the cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF) complex required for 3' processing of mRNAs human CPSF1 involved in the RNA recognition step of the polyadenylation reaction ATGAGCCACCATCAAGTTTTTCAAAAACAAGTTTTAGCTCCAACTGGTGT TGAACAATGTATAAAAGCAAATCTTATAAATGATGACTCAATTAATTTAG TATTAGCTAAAACAAATGTTTTACAAATATATAAAATCAGATATGAAAAA ATAGAAAAATATGAAAATGTTTCAGATTCACAACCCCAACAACAGCAAGA ACAAGAACAACAACAACAAGATATAACACAAAAGAAAAAGATTGAATTAA AACCAAGTTTAGAATTAATAATTGAAAAGAAATTATTTGGAAATATTGAA TCTATGGCAAGTGTTAGATATCCAAATTCAGAGAGAGATTCATTGATTTT AACATTTAGAGATGCTAAAATATCAGTATTAGATTACGATTCAGATTTAT TAGATTTTGAAATTCGTTCACTTCATTACTTTGAAAAGGATGAATTTAAA GGTGGAAGAAATCATTTCAAACATCCACCATTACTAAAAGTTGATACTCA ACAACGTTGTGCTGTTATGTTACTATATGATAGAAATTTAGCGGTTTTAC CTTTTAAAAAAACAAGTTCAATTTTAGATGATGATGATGATGACGACGAC AATAATGATGATGATGATGATGAAAATAATGAACATGACGAAAATGAAAA TGAAAATGAAAATGAAAATATTATTAAAAAAGAAGGTGATCAACAAACAA AAGAAAAAGAATCAGTTGATGATGAATTCGATTTATTATTTGAAAAAGAT TCTTCACCACCACCACCATCAACTGCAGCAACAGCAGAAACAACAACAAC AATTAAAAAAGAATCAAATAATAATCAAGATAAAGAAAAGAAAAATATAG AGATTGAAAATGTTAAAGATTTTTGTTTTTTACATGGATATTATGAACCA ACGATATTATTTTTACATGAACCAATTCAAACATGGACAAGTAGAATAGC AGTAAAGAAATTTACATGTCAAATGACAGCTATATCATTGAATTTATTGA CAAAGGCAGGATCATTCATTTGGAATGTTTCAAATTTTCCATACAATTGT 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AACAAGTTTTAACACCAAAATCATCACTTTCAAAAAAACAATTACAACAA CATTTACAAAAACAAAAAGAGAATGGTATAAATAGTAAAAATAATTATAA TCAAATTCAAAATTCTGAAATTTTAGATATTGTTGAAATATCATTACATA ATTTTAATAATTCTGATCCTTATTTATTTATGTTTAATAAAATTGGAGAT TTAATAATTTATAAATCATTTAAAAGAGAAAAGAATGGTGAATTAAGATT TAAAAAATATAATCATTCATTTATATTAAGAGATTCAGTGACGGAATTTT ATCAAAAACAACAAGAGAAAGAATTATTAAATGGTATGGATGACGATGAT GATATGGATGATGAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAA TTTAAATCGTCAAAAAAGAATATTTGAATTTAGTTCAATTAGTGGTAAAA GAGGTTTATTCATTGGTGGTAAAAAACCAATATGGGCATTTTGTGAAAAA GGTTATCTTAGATTACATAGTATGGATTCATCTGATAATTCAAATAGTAA TAATTCGAATAATAATAATAATAATAATTCAAATACAGTTGAAACTTTTA CATCATTTAATAATATAAGTTGTCAAGATGGATTTATTTATTTTAGTAAA GAGAAAGATGTTATAAAGATTTGTACATTATCAACTTTAATGAATTTTGA AAATGATATTGCAATTAGAAGAATTCCAACAAAGAATAGTTGTCATAAGA TTGCATATCATAGTGAAGCGAAATGTTATGTTGTTATTGTATCATTTCCA CAAGTTACCCAAGAGTTACAAGAGGATTCAAAGAAACCAATTTTAACTGA TGATAAATTTCAAATTAAATTAATTGATCCAACAATCGATTGGAATTGGA AATTTATTGATAGTTTTTCACTTCAAGATAGGGAGACTGTATTGGCAATG 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GGTGGTAGTGATAGAAGAGGAGGAGGTAACTATAATAATGGTAGAGGTAG TAGTAGAGATAACTATAACAATATTAACAATAGCAGAGACTACAGAAATG ATCATGGTAAAGATTACGATAGAAAAAGAGAAAGAGATTATTATAATGAT GATGATAGAAGAAAGAGAGATAGAAATTATTAA >DDB_G0286645 cstf3, component of the CSTF complex which in mammalian is required for polyadenylation and 3'-end cleavage of pre-mRNAs ATGGAAGATGAAAATAAAGAAGTTATGGATACTTCACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAC AACAACAACAACAACAACAACAGCAACAACCATCACAAGATACTATAACT TCAACAACAACAACAACTACAGATAATAGTGGACCAACAACAACAGTAGC AGTTTCACCTCCAACAACAACAGCAACAGCAGCAGTTTCACCAACACCAG AAAATCAAAATGTTACAACACCAACACCCATATCACCAAGTTTATCAAGT GTTAATGTTTCACCAACTACTGCAGTAACTATTACAGCTTCACCAACAAC TTCAACAACTACTACAGCTTCACCAACAACTGTAGCAGCACCAACAACAG TTGGTAGTACACCAACTACAACAACAGCATCACCATTAGGTAATATTTTA TCATTAAATATGCCAGCAGTTGGTAAAAGATTAAATGTACAAATTGAAAC ATTAGAAAATAGAATAAATAATGATATGTATGATACTGAAGCATGGACAC TTTTATTAAATGAAGTTCAATCACAACCAATTTCAATTGCAAGAGATATT TATAAAAGATTCTTATCTGTATTTCCAACTGCGGGTAGATATTGGAAATT 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TTTTATTTCCTTCAAAATTTACCTTCGAATCAATCATTTATGGGACCATA TATAGATCCTGAACAATTGATTGGAATTATTAGAGATACTCCTTTACCAA TACAATTTTTAAATCAACAACAATTACAATTACAGCAACAACAATTACAG CAACAACAATTACAATTACAACAACAACAACAATTACAATTACAACAAAT ACAACAACATCAACAACAACAACAACAAGCAAATAGAACCTCACCCACTT TATCAAATGAAACTTTAATTATTCCTAATAAACCTCAACAACCTCAACAA CCTCAACCTCAACAAACACAAACTCATAAAAGAAAACAACCAGATGATGA ATCAAATAATGAACAACAACAACAACCACCACCACAACAACCACCACAAC AACAACAAGAACAACAACAGCAACCACCAACAACAACAACAGCAACAACG AGTGTAGTATCACCAATAACAACACTAAATTCAACGCCAATATCAGCTCC AACTACAGTATCTCCAATCACTACAACGACAATCCCATCAACAAGTTCAC CAACTACAACATCAACAACTGTAACTGCTAAATCACAACAATCAGCTTCT GATATATACAGAAAACGACAGGCAAATAAACTTTCTAAAAAGTCTTAA >DDB_G0290485 dlrA, ATGCAAAATCACCAGAATCAAATGAATGTTGATCATCAATTTTATTTTAT ATCAGGACAAGATCAATCAAACAATTTAGAGACGCAAATAAAAAAAGAGG ATATAGATATTTCAGATCAAGCATCATATCACCAACCTGGTTTGGATAAA AATAATAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAGTAATAGTAATAGTAA TAGTAATAGTAATAGTAATAGTAATAGTAATAATAATAACAATAATAACA ATAATAATAATAATAATAATAGTAATAATAACAACAATAATAATAGTAAT 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CTAAAGCCTTATGTGAAGCTCTATGGTACAATCAATCATTGGCTTCAATA CAATTAAACCATAACAATATCAATACTCAAGGTGTACAGTTCATGAAAGA GTTATTGCTTCGTAGTTATTTGGTTAATTTAGATTCTTATTTTTACCCTC CAACCTCAACAACTATTGTATCAGTCTTATATGTAACTAGAGGTCGTAAT CGTGGTTCTAATAATAGAAATAATAATCTTAATACAAATCTTCGTATTAT TGTATAA >DDB_G0288797 fip1l1, ortholog of yeast FIP1 and mmamalian FIP1L component of the cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF) complex required for 3' processing of mRNAs directly interacts with poly(A) polymerase ATGAGTGAAGTTGAGGAACAAACTTTAATAAAAGATGCATCAATGAATGA ACCAACAGATAAAACCACCACTGAAGGCGATAATGGTGGTGAAAATGAAA ATGAAAATGAAAATATAGCAGAAGGTGGTGAAAATCAAGAAGATAATAAT AATAATAATGAGGGGGAGGAAGAAGAAGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGA AGAAGAAGAGGAAGATGAAGAATCAGATGACGATGATGTTGTTGTACTTT TAGATCAAGAAAGTGTTGAAGCATCATCGAGTAAACCTGGTGCAACATTT AGAACTACACCAAATAAATTTTCATATAGAAATCCATCATCGATTACACC TGGGTCAGGTGGTAAATATATGTTAACAAAACAAACACCAACAGGTGGTG GTGGTGGTGGTAGTGGTTTCAATTCAGCTAAATCAAATCAAAAAACAATC TTTGAATTTGATATCGAATCATTTGAAGAGAAACCTTGGTTAAAACCAGG TGCTGATATTTCAGATTATTTCAATTATAATTTCACTGAAGAAACTTGGA AAGCCTATTGTGAAAGACAAAACACAATGAGAATGGAATTAAATAATTTA GGTAAAATTAAAGGCTATGAAAGTAATAAACCAAATATTGGTGGTAATAC CACTGGTGGTACTGGTGGTAATGGTATTGGTGATAAACCAAATATTACCA ATGGTAATTTAGGTGTTGGTGTTGGTGGTGGTATTGGTGGTGGTAGTAGC GGTAGTGGTGGTAGTATAGTTGGTGATTTACCACCAGAGTTACAAGGTGA TAAATTACAACAAGGAATTCAAAGACCACAATTTAAACGACAACCAAGTA GATCTGATATTAATGATGAATCAAATTTAGATCAACAACAACAAACTGAT GGTAGATTTAATAGAGGTGGTCAACAACAAATACCTCCTCAACAACCACA ACCACAACAACAACAACAACAACCACAGCCACAACAGTATCAAACAAATT ATCAAAGAGATAGAATTTATAATCAAGATTATCGTGGTAGTGGTAGAACA TATAGTACAACTAATCAATATGAGGATGATAGTAATAATAATAATAATGG TAGTGGTAGTGGTGGCGGTAGTGATAGAAGAAGAAATGAAAGTTCATCAT CATCATCAAGAGGTGATTCTGATAGGGGTGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAT AGAGATGATAGAGATAGAAGTGAAAGAGAAAGATCGGATAGAGATAGAAG TGAAAGAGAAAGATCAGACAGAAGTGAAAGAGAAAGATCAGATAGAGATA GAAGTGAAAGAGAAAGATCAGATAGAAGTGAAAGATCAGACAGAGATAAA ACAAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAATAATAATAGTAGTTCATCAACAAG AGGTAGTGATAGATATGATAGAGAAAGAGGGGGTGATAGAGATAGAACCT CTGAAAGTAGTAGTAGAGGGAGTGATAGAGATAGAGATGATTATAAAAGT AGAAGTAGTAGTAATACTGGAGGTAGCAGTAGTAGTTTAAGATCAGACAG AGATTCAAGAACACCAAGTAATACAAGTAGTAACTACTCCTCTTCTAATC CCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCAGATTATAAAAGAAAGAATTATAATACT GACAGTAATGATAGATCAAAGAAAAGAAAATAA >DDB_G0302418 imp4, ortholog of the conserved eukaryotic IMP4 component of the 60-80S U3 small nucleolar ribonucleoprotein (U3 snoRNP) required for pre-18S rRNA processing forms a heterotrimeric complex containing IMP3 and MPP10 ATGTTAAGAAGAAATGCACGTTTAAGACAAGAATATTTATATAGAAAGAA TTTAGAAGGAGCAGATAAAGAAGATTATGAAAAAAAGAGAAGAATTAAGA AAGCGTTGGATGAAGGTAAACCAATTCCAACTGAATTGGTTGATTTTGAA TTTAAACATAGAGATGAGATGAAATTAGATAAATTAGATGGTAATAGACC AAAATCAATTGATGATGAATATGCACGTGCAGGTATTCAAGATCCAAAAG TATTAGTTACAACAAGTAGAGAACCAAGTTCACGTTTAATTCAATTCACA AAGGAATTAAGAATGTTATTCCCAAATTCTCAAAAAATGAATAGAGGTGC ACATGTCGTCAAAGAATTGGTTGATGCATGTCGTGCCAATGATGTAACCG ATTTGGTAATTGCACATGAACATCGTGGTGAACCAGTTGGTTTAGTAATT TCTCATTTACCATATGGTCCAACTGCTTATTTTGAAATTAAAAATTGTGT TATGATTCATGATATCGATGAAGCAACACCACCATCTTTAGCTTTTCCAC ATTTAATTTTTCATAATTTTACAACTCCATTAGGTGAAAGAACCGAAAAT ATATTAAAATATTTATTCCCAGTACCAAAGGATGATAGTAGAAGAGTTGT TACATTTTCAAATGATAATGATTTCATTTCATTTAGACATCATATTTATG AAAAGGATGGTTATAAAAATGTAATTTTAAAGGAAATTGGTCCAAGATTT GAATTAAAACTTTATAAAATTCAATTGGGTACTCTTGATCAAGATGAAGC TGACCTTGAATGGGTATACAAACCATACATGAATAGTACAAAGAATAGAT TATTCCTTTAA >DDB_G0293900 mybA, ATGCAACCTAAAAGAATGTCACATAATCTCACAGTTGGAGAAAAAGCAGG GTCACCTTTCAATGTGATTCTAAACGCTGCCAATAATACAAATTCAGATA ATAGTAGTAATAATAGTGATAATGAAAATGATGATAATCAAAACAACAAT AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAAGAGGAAGAGGAAGA AGACGATGATGATGATGATGATTCACAACAAAATAGACATAATATATCAA TACCATTTACGATAAATAAGAATAGTATTAATAATAATAATAATTTAATT AATAATATAAATAATAATATAAATAATATGAATAATAATATGAATAATAA TAATAATAATAATAATATGAATAATAATATAAATAATAATGGTAATAGTA ATATTAGTAATAATAATACACCAAAGGTAGAAAAAAAAAAGACAAAAGGA AAATGGACATCTGAAGAAGATCAAATTTTAATTAAAGCAGTAAATTTACA TAATCAAAAGAATTGGAAAAAGATAGCAGAGCATTTTCCAGATAGAACAG ATGTTCAATGTCATCATAGATATCAAAAAGTATTACATCCAAATCTAGTG AAAGGAGCATGGACAAAAGATGAAGATGATAAAGTGATTGAATTGGTTAA AACCTATGGACCAAAGAAATGGTCAGATATTGCACTTCATTTAAAAGGTA GAATGGGTAAACAATGTCGTGAAAGATGGCATAATCATTTGAATCCAAAC ATTAAAAAAGAAGCTTGGTCAGATGAAGAAGATCAGATCATTCGTGATCA ACATGCAATTCATGGTAATAAATGGGCGGAAATTGCTAAATTTTTACCTG GTAGAACTGATAATGCAATTAAAAATCATTGGAACTCTTCAATGAAAAGA GTTTCAAATAATAATGTACATCTTAAATCACATGCAATTGAACATTCTTT ATCCTCACAAGATAATCAAGATTCTCCAAAATCAATTATTACATCTTCTT CACCTATACCTACTACTACCACAACCACTACCACCACTTCTACAACTTTA ATTACACCACCACCACCACCACTACTACCACCACCACCTTCAATCAATAA AAAAGAGAAAAAAATTAAACAGCCAAAAAAGAGAAATGCTTCAGAAATCG AACAAACTCTTTCTCAACCACATATAAATCAACACGAATCTTCACCAATA GTATTTGAAAATATTAGTAATGGTAATAATAAAATTGATATTCCTGCCGC TCAATACTTAATGACTAATGGTATATCATGTATAAATAATAATAATAATA ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT AATAATAATAATAATAATAATAACAATAATAATATTAATAATAATAATAA TATTAATAACAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATAATAATA ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCATAGCAATGTT AGTGCCAATACCAATAACAATAATAACACAATAAATAATAATGTATCACT 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CATTGCTAACAATCAATGCAAAACTTAATAACAACCATCATAAAAATTAT TTAGATTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATC ATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCAGCAGCATCTT CGTCATCAACTCCAAATAATCAATCAGATTTAGCTACTGTTCCATTCACT CCAGATGATAATGTTTTTAATAATAATAATAATAATAATCCGCCTACACC TGGTAAAACCAAATTTAAATCTAGATTTTCACCAAACTCAAAACCATATT CTTATCCACAAGAATATGATAACTATGGGCAATCTTCATCAACACCACAA AATATTAATAACACCTACAATTCAATTTGTTTAGGTACTAATAACAATAA CAATAGCAATAGTAGTGCGAGTAATAGCTTTGAAAATAATGAAGAAAACA ATAATGAAAACGATAATAATGGAAGTAGTAGTGGTGGAGATAAAGTACCA CAAATGGATTCATCATTTATGGCATTAAAATTATTAAAAGATAATCCAAA CAAATCATTATTCTCCAAAGCAAGAAAAATACTGGGATTGGGTAATATTT CATCTTCTTCTCTTTCTCCCTCTTCTTTTGTTCAACAAATTTCAAATTCT GCATCTGCTTCTTCCACACCAACATCATCTTCATCAACTCCTTTATCATC ACCTACAACCACAACCTCTTCTGTTGCTGCAGCTATAATAAATAAAATTT CATCAACTCCAAAATACTTTTCAAATCAAAATCAAAATCAAAATAATAAT AATAATAATAATAATAATAATATAAGTAATAATAGTAATTTATCAGCATT TTCAACTCCTGGTGGCAATGACCATGTTCCAAACTTTGAAAGTAATTCAT TTTTAGCACAATCTCCATTTCAAGATATTTTAAATTCTCAAAAATTGGAC 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GTTGCCACCAATCTCTTCCTCCATTGTAAGTGATAATTCCTCATCTTTGT CAACTCCAACTGATTCAATTTCATCTTCACCTTCAACTTCACCAATTACT TTAAGTAGTAATGTAGTTGTAAATGATTTTGATTCACAACAACAACAACA ACAACAACAAACTTATCAACAACCACCACCACAATCACAAGATAGTGGCA ATAATCAATTCAATTTTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT AATAATAATAATAATAGTGTTGAGTCCATTAAATTATATACAAATGTAAA TATTTCATACATTTAA >DDB_G0289319 mybQ, ATGTTGTATTGTGGATCCACAGGGGGGCATTATATGATCATGACAACGAA CAACAATAGTAATAATAATAATAACAATAATAACAATAATAATAACAATA ATAACAACAATAATAATAATAATATTAACCAAAATCATCAACATCAACAT CAACATCACCATCATCAACAACAGCAACAACAACAACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGCAGCAGCAACAACAACAAC AACAACAAAATTACGGAGAGAGTACGACATCTACTTCTATGATTCCACCC TCCATTACAACTTCATTAACACCATTAACACCAACATTATCATCTCAACC ACAAAATATACAACAACAACAACAACAGCAACATCATCACCAACAACAAC ATCATCATCATCACCAACAAACTCAACAACAACAACAGCAAATATTATCA CCAATGATGGGAAGTAAAAGAAAACTAGAGGAGGATATGGGTGTTGGACA ACCAACATCCAATTTAACCAATGAATATTTAATGAGTAACAATAATAGTT TGAAACCAATATTGGTGTCATCACCACTTTTAACACCATTATCAGCATCA CCTGGTTTAACTTCGATGCAAATGGCATTTGCAAATGCATCGTTATCAGC ACCATCAACTCCATTGAGTATGTCACCTTCATTGGGGCCGTGCTCAGCAC CAATGTCACCATCTAAAAAGAGTAAAAACAGCAGAAGTAGCAGTAAGAGT AAATATCAAAATTCAGAGGAGAGATGGCAATCTACAACCAGTAAAGACAA TGGTAAACCTTCTAGTCCTGGTATAGTTAAGGGACCTTGGAAGGATGAAG AGGATGCAAAATTGGTAGAGTTGGTTAATAAATGTGGACCAAAGGAATGG TCTTCAATAGCAGCTAAAATACCCGGTAGAATCGGTAAACAATGCAGAGA GAGATGGTTCAATCATCTCTCACCAGAGGTTAGAAAAACAAATTGGACCC CTGAAGAGGATAAAATTATCATTGATGCTCACGCTTCGTTGGGTAATAAA TGGACTGCAATCTCTAAAATGTTGGATGGTAGACCTGCAAATGCAATTAA AAATCATTGGAATTCTACCCTACTCAAAAAAATTGGTGGTGATTCAAAAT CTTTAAACAAAGAGAAAGATGATGACGACGATGACGATGAAGATGCAGAG GATGGTAGTTCTCCAGTTTTATCTCCAATATCTTTATATCAATCTTCCTC TTCAACAACAACAACTACTACAACTACTACAACAAATTCTTCTGAAAAAT CAAATATTCCACCTTTTGCACTCTCTGGTAGTACAACAACCTCTACAAAT AATTTAAATAATAGTACAAATAGTACCAATAGTATTAATAATAATAATAA CAATAATAACAATAATAACAATAGTAGTAATACCAATACAGCAATAACAA CCAATGAACCTTTGGTTGCACCAAAAATAATTAGGGCTCAAACAACCCCA AATTCTTCACCATCTCTTTCTTCCAAAAAGACACATGACAAACAAAAAGT 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ATAACAATAACAATAACAATAATAATAACAATAACAACAACAACAACAAC AATATCCCAACTCCAAATATGTCAGCTTCTACCACTGGCACTATAAATCA TCATATTCATCAAACTCATCACCATTTAACTACACCTTTATCACAATCAA CACCTTCAGTTTCAACAGATCAAAATAACTATATCAATTACGATATTTCT TCGTTGTTTTCGCTTCCTAATGAAATTTAA >DDB_G0288259 papA, RNA polymerase that specifically incorporates ATP at the 3' end of mRNA ATGAATAAAAATGGTGGACCACCAGTTGCCAATATAACAACTTCATCCAC TACAATCACATCTACAACCACAACACAAGCAAAATCACAATTACCATCAT CACTTTCGGTAAATAATTTACACACAACACAAGGTTCAACTGATCAACCA ACCATTTTGGGTGTAACTGAGCCAATTTCAACCGCTCCACCATCATCTAT TGATTTTAAACTTTCCACTGAACTTGAGAATACATTAATTTCTTTCAATT TATTTGAATCACCAGAGGAGAGTAGAAAAAGAGAAGAGATTTTAGGTAAA TTAAATCAAATTGTTAGAGAATGGGCAAAACAAGTTAGTTTAAAAAAGGG TTATCCAGAACAAACTGCATCAGAAGTTGTAGCAAAAATTTTTACATTTG GTTCATATAGATTGGGTGTACATGGCCCAGGTAGTGATATTGATACACTT TGTGTTGGTCCAAAACATATAATGAGATCAGACTTTTTTGATGATTTATC AGATATTTTAAAAGTTCATCCAGAAATTACAGAATTTACAACAGTCAAAG ATGCATTTGTACCAGTTATAACAATGGTATTTTCAGGTATACCAATTGAT TTAATTTATGCAAAATTAGCATTAACAGCAATTCCAGAAGAATTAAATGA 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GTCCTGAAGAACCTGTAAAAACTACAAAGAAGAGATCTTCAACTGGTGAA CCTTCTGCAACTAGAAAGAAATTAAAAAGTGAAAATTCTGATAATAAATT AAATTCTCCAAAATCTCCAATAACTACAAATATTAATTCTACACCTACTA CTTCCACTCCTACTACTACTGCTAATACTACCACTAATACTACCACTGCT ACTACTACTACCACTACTACAACTGTTCCGATCACTTCCACACCAACTTC AAATATTTCTTCACCAACTATGAATTCTACAGAGTTAACTACACCAACTT CAACCTCTACAACAACTTCAAATGATTCAATTACAACTCCTCCTACCACT ACAACTATCAACTCTGTACAACCACCATCTGCACAACCAACCGAAAATGG TTCATCAACATCTAATTCACCAACATCTACTTCAATAAATAATACCGCAT TACCACCCAATCCAACCACAAACAGTGAGTCAACTATTGAAACAACAATA ACCCTACCAACAACATTAGAGTCACAAACATCAACATTAAAAGATAGTAA CGAAATATCCACCAATGGTACAGCAGTTGCAACTGAACCAACAATTACTT CACCATCTGTAAATATAAATGAATCATCAACATCAACATCAACAACAACT ACAACAACAGTAACCGAACAACAAATTCAAACTGCACCAACAACTGCTAC TCCAATAAATAAAACCATTGTAAACACTATGGAAGTTAATGAATTAAGCT TCATTTCATCTTCAAGTGAAACTTCTCAATCTAAACCACCACCAAAGAAA CCAACTATCAGTATTATTAGAGGCAATTAA >DDB_G0283543 prp40, ortholog of prp40 which in yeast is a U1 snRNP protein involved in splicing ATGTCAAGTGATTGGGTAGAAGCGATTGCAGATGGTAAAAAGTTTTATTA TCATAAAGTTACAAGAGTCAGTGTTTGGGAAATACCAGAAGATTTAAAAT CACCAGCACCATCATCTAATGATTCAAATTCAAATAATCAACCAGTTATC ATTGGTGATTGGAAAGAATATAAAACAGATAAAGGTCAAAAATATTATTA TAATACAATCTCAGGTGTAAGACAATGGGATGCACCACCTGAATTTCAAC AAAAATTAGCTTCAACAACAACATCAACATCAACATCATCACCACAACTA TCATCTAGTGGTTCAACAACAATTACAACTCCAATACAACCAATTACAAC CTCAGCAACACCACAACAACCACAACAAGTAAATAGCAATAATAATAGTA ATAATAATAATAATAATAAAGATTTAAAAGAATCTAAAGATTCTAATATA AATACAAATAATTTAGATACACAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACA ACAACAACAACAACAACAACAACAAAATAAAGAAGATCCAATTCAAACAT TTAAAAATTTATTAACAGATAATTCAATTAGTTCAATATGTACATTTGAG AAAGCACTTAAATCAATTGCAAATGATGAGAGATATCAAGTTTTAAAGAC AATGAGTGAACGAAAACAAGTATTTTTAGATTACCAAGTTGATAGAAAAA AAGTTGAACAAGAAGAAAAGAGAAAGAAAGAAAAGAAAGCCAAAGAGGAT TTCATTCAACTATTACGTGACAGTAAAGAGGTAACACCACTAATGTCATG GAGAAGAGCATCACTCTATTTCGAATCGGAACCACGTTGGGAAGCAATAG AGAGTGAACGTGAACGTGAATCATTATTACATGACCATATTCAAGAATTG GAACAACAAGAAAAGAATCAATTAATGTCAATTAAAAAAGAACAAATGAA AATTTTACGTCAAAAATTAGAATTGGATCCTTCGATAACCGTTTTCACTC AATGGCGTAAAGTTAGAGATCAATTCGAAAATGATGATGTCTTTCAAGTA CTTGATAAATTCGATTTCTTAACAGTATTTGAAAATTTCATACGTGATTT AGAAAAGAAATTAGATGATCAAAAAAGATTAGAAAAAGAAAAATTAAAAA AAGATTCAAGAAAAGATAGAGATAATTTTAGAGAATTATTAAATGAAAAA TTTAAAAATGGTGAATTACATGCATTAACAAAATGGAAAATATTTAAATT AAATAATGAAAATCATCAATCATTTATTAATTTAAGTCAAAAATCAATTG GTTCAACACCTTTAGAATTATTTTCAGATTTTAAGGATGAATTAGAGATA AAATATGAAAATGATTATAAAAAATTAAAAGAGATATTAAAAGAAACAAA TTTTAAATATTCACCTGAATCTACAACTTTAGAATCTTTAAAATCTGAAT TTTCAAAACATTCAAATTATAATTTAATTCAAGAATTTAATTTCTTACCA TATTTAGAATATTTAAAATATAAAGAAGAAAGTAGAGAAAAGAATTTAGC AAAGAAAAAGAAGAAAAGAATTTCACAATTTAAAATATTATTAACAGAAA CTAAAGTAATAAATAAATCATCACAATGGTCAGATATTCAACCAATTATT GAATCAAAGAAAGAGTATATAGATTTAGGTGATGACCAAGAACGTTTAAG AATATTTAAAGACTATATTGAATTTTTAGTTCAAAATGCACTAGATGAAG AAGAGGATGGCAATGAAGAGGGTGAATTAGTTCTTTCACCAAAGAAACCA TCAAATGATCAATCATCTTCAAAGAAAAGACGATCTTATATTGATAATTT AGATGATGAAGATCGTTATGGTACTGGTAGTGGAAGTGGTAGTGGTAGTG GAGGTGGTAGTGGTGGTAGTAGTAGTGGAGGTGGTAGTGGTAGAGATAGC AGAGATAGCAGAGATAGAGATCGTGGTAGTGATAGAGGTGATAGAAGAGA TGATAGAGACAGAGGTAGATCTTCACATAAAAAAGAGAAAAGATAA >DDB_G0274229 prpf8, central component of the U4U6-U5 snRNP complex contains the PRO8NT PROCN PRO C-terminal and Mov34MPNPAD-1 domains found in pre-mRNA splicing factors of the PRO8 family ATGGATGATACTAATAGTAATATTAATCAATCAAATGAATCACAACATTT AGAAGAAAAAGCAAAAAAATGGATTCAATTAAATAATAAAAAATATAGTG AAAAAAGAAAATTTGGAGCTGTAGAGATTAGAAAAGAGGATATGCCTCCA GAGCATTTAAGAAAGATTATAAAAGATCATGGTGATATGTCAAATAGAAG GTTTAGAGATGATAAACGTGTTTATTTAGGAGCATTGAAATATATGCCAC ATGCAATTTTAAAACTTTTAGAGAATATACCAATGCCATGGGAACAAGTT AAATATGTTAAAGTATTATATCATTTATCAGGTGCAATCACATTTGTAAA TGAAATACCATTCGTAATTGAACCAATCTATATTGCACAATGGGCAACTA TGTGGGTTACAATGAGAAGAGAGAAAAGGGATCGTACCCATTTTCGTCGT ATGAAATTCCCATTATTCGATGATGAAGAACCACCATTAGATTACTCTGA TAACATTTTAGATAATGAAGTTGAAGATCCAATTCAAATGGAATTAGATG AAAATGATGATTCTGAAGTAATAGATTGGTTATATGATTCAAAACCATTA GTTAATACAAAATTTGTAAATGGTTCAAGTTATAGAAAATGGAGATTAAA TTTACCAATTATGTCAACATTATTTAGATTGGCATCACCATTATTAAGTG ATTTAACAGATAGTAATTATTTTTATTTATTTGATGATAATAGTTTTTTC ACATCAAAAGCATTGAATATGGCAATACCAGGTGGACCAAAGTTTGAACC ATTATTTAGGGATGTTGATGATGATGATGAAGATTGGAATGAATTCAATG ATATCAATAAAGTGATTATTAGAAATAAGATTAGAACAGAATATAAAATT GCATTCCCATATCTATACAATAGTAGACCACGTAAAGTTAAAACACCAAC TTATCATACTCCAAATAATTGTTATATTAAAAATGATTCACCAGATTTAC CTGGTTTTTATTTTGGTGCTGCATTAAATCCAATTCCATCATATAAAACA AGTGGTAATAAAAATGAACAATCTGAATATGGTACAGAAGATGATGAATT TCAATTACCAGAAGAAATTGAAACAATATTATCAAAAACAGAGATTGAAC ATGATAATTTAGCAAATGGTATACAATTATATTGGGCACCAAGACCATTT TCATTAAGATCAGGTACAACTAGAAGAGCAGAGGATATTCCATTAGTTAA ATCATGGTATAAAGAACATTGTCCAAGTGAACATCCAGTTAAAGTTAGAG TTAGTTATCAAAAGTTATTGAAATGTCATGTATTGAATAAATTACATCAT CGTAAACCAAAAGCACAAACTAAAAGAAATTTATTTAAATCATTGAAAGC AACTAAATTCTTTCAATCTACAGAGATTGATTGGGTAGAGGCAGGTTTAC AAGTTTGTCGTCAAGGTTACAATATGTTAAATCTATTAATTCATAGAAAG AATTTGAATTATTTACATTTGGATTACAATTTCTATTTGAAACCAATTAA AACTCTAACAACAAAGGAGAGAAAGAAATCAAGATTTGGTAATGCATTCC ATTTGTGTAGAGAGATATTACGTTTAACTAAATTGGTGGTTGATGTTCAT 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AAGAATGGTTTGGGTTGACTTGGAAATGACAGGTTTGGATATTTCAAAAG ATGTAATTTTAGAAATGGCTATTGTCATCACTGACGCAGAGTTAAATGTT ATTGAAAAAGGTCCAAATTTAGTCATTCACAGATCAGATGAAGTTTTAAA GAATATGAATGATTGGTGTATTGAACATCATGGAAAATCAGGATTAACAG AAGATGTAAGAAATTCAAAGATATCATTAGAAGAAGCAGAGAAAATAATG TTAGAATTTGTGAGAAAGCATACAGATAAAGGAATTTGTCCATTAGCAGG TAATACAGTTCATGAAGATAGAAGATTCTTATTAAAGGAAATGCCAACAT TTGCAGAGCATTTACATTATCGTATTATTGATGTTTCAACAATTAAAGAG TTATCAAGAAGATGGTATCCATACATTCCATCACCAAAAAAAGTTTGTGG TCATCGTGCATTACAAGATATTGAAGAAAGTATTGAAGAATTAAAATCTT ATCGTGTTACTGTTTTTAAATAA >DDB_G0273741 rexo2-2, similar to H. sapiens REXO2 and S. cerevisiae REX2 a mitochondrial 3'-5' RNA exonuclease there is a second copy of this gene ATGTCCACCACACCAACATACAATCATCCAGTTATTAATGAACGTTCAAA AAGAATGGTTTGGGTTGACTTGGAAATGACAGGTTTGGATATTTCAAAAG ATGTAATTTTAGAAATGGCTATTGTCATCACTGACGCAGAGTTAAATGTT ATTGAAAAAGGTCCAAATTTAGTCATTCACAGATCAGATGAAGTTTTAAA GAATATGAATGATTGGTGTATTGAACATCATGGAAAATCAGGATTAACAG AAGATGTAAGAAATTCAAAGATATCATTAGAAGAAGCAGAGAAAATAATG TTAGAATTTGTGAGAAAGCATACAGATAAAGGAATTTGTCCATTAGCAGG TAATACAGTTCATGAAGATAGAAGATTCTTATTAAAGGAAATGCCAACAT TTGCAGAGCATTTACATTATCGTATTATTGATGTTTCAACAATTAAAGAG TTATCAAGAAGATGGTATCCATACATTCCATCACCAAAAAAAGTTTGTGG TCATCGTGCATTACAAGATATTGAAGAAAGTATTGAAGAATTAAAATCTT ATCGTGTTACTGTTTTTAAATAA >DDB_G0276159 rtc1, ortholog of RTC1 which catalyzes the conversion of 3'-phosphate to a 2'3'-cyclic phosphodiester at the end of RNA ATGGGTAAAAATAAAAATTATAATAAAAATCAATTTAAAAAATCAAAAAC AAATAATGATACCACAGTAGCACAACAACAACAAACAATTGAAGAAAAAC CAGATTTTAAAATTGATGGATCAATTTTAGAAGGTGGTGGTCAAATTTTA AGAAATTCAGTTGCATTAGCATCATTATTTAATAAAGCCATTTCAATTGA AAAGATTAGGTATAATAGAGATCAACCAGGATTGAAAAATCAACATAAAG CTGGTATTGATTTAATGTCACGTTTATTTAAAGCTCATTTAACAGGTTGT AGTGTTGGTTCATGTAAACTTTATTATCAACCAACACAAAAGACAATTCA AGATGATGGTGTAATTGAAGCTGATACTAAAACAGCTGGTAGTATTTGTT TGATGATTCAAGTTTCATTACCATGTTTAATCTTTGCACCACATTCCACA AAGATGGTATTGGGTGGTGGAACAAATTGTGATTTTGCACCAGCTGCAGA CTATATTCAAAATGTTTTCCTACCAATTGCAACAACTATGGGATTTAAAT GTGAGATGAGTATTGATAAAAGAGGGTTCTACCCAAAGGGCGGCGGCGCT GTCACATTGACAACCCAACCACTCACACAACCACTCTCGCCAATCACCAT AGTGAATAAGGGTGAGGTGAATAGAATTGTAATCAAGTCCTATTTCACGT CGCCTAGAATATCACCATTGGTAGCAGAGAGGATGAATAACACTGCAAAG AAATTAATAAAAAAGGATTTTAAAAAGGTGGATGTTGAAACAGAGTTAAT CGATGTGAGTAAATTTAGTTTTGGTGATGGTACATTCATTGAAATTAGGG CATACACCGACCAAGGTTGTATATTTGGTGCAACTGGAAATGGTGCAATT GGTGTACCTGCTGAAAAAGTCGCAGAAGATGCTGCAAATTCTTTACTCAA AGATTTGCAAGATGGTGGTTGTATGGATGAATACCTTCAAGATCAATTAA TCATTTTCATGGCTTTAGCAAAAGGTAAAAGTCAAATTAAAACTGGTCCA ATCTCATTACATACTCAAACTTCAATTCATATAACATCTTTAATGACTGG TGCTATTTTTACAATTACACCATTAACTAATAATACTCAATCTGGTGAAG AAACAAATTTAATAACTTGTGAAGGTATTAGTTATTTTCCATCTGATTTA AATAATAATAATAATAATAGTAATAGTAATACTACTACTACTACAACTAC CACTACAATTTCAACTACAACTATTGATAACCAAAATAGTGAAGAAAAAT AA >DDB_G0293554 sf1, ortholog of the conserved splicing factor 1 binds to the intron branch point sequence (BPS) of the pre-mRNA necessary for the ATP-dependent first step of spliceosome assembly ATGTCACCCAATGATGTTGAACAACAGCAGCTACCAACCCAAAATAACAA CTATAATGATAATATAAATAGTCCATCATTAAATGATGATGATGAGGATT CATTTTTTAGAGAAATTAAAGAAATTAGCAGAGGTAGACCAAAAACTAGA GATGAAATTCAAATAAGTGATAGAACAAGACTATCAAGATGGGATACACC TTTAACAAATGATGGGGTTTCACCTTTTTCAAGTATTTTTAAAACCCTAC CACCTGGTTTAACTGATGAACAAATTGCTGCTTTAATTTTAAGATTAAGA GTTGATGAAATTACAAAGAAAATTACAATTGGACCAATTGAATTTACAGA GAGAGATAGAGAGAGATCACCATCACCACCACCAACTTATGATAATAATG GTAAGAGATCAAATACAAGGGAACAGAGAATTAAGGAAAAGCTACAAAAG GAGAGACATCAATTGGTTGTAACAGCACAACAAATCAATCCAACCTATAA ACCACCATCAGATTATCAACCACCAAATGAGAAGAAAACTAGAAAGATCT ACATCCCAATAAAGAATCATCCAGAATATAATTTCATTGGTTTAATCATC GGACCACGTGGTAACACACAAAAACGTATGGAGAAAGAGTCTGGTGCAAA AATTGCTATCAGGGGTAAAGGTTCATCACGTGATGGCAAACCAACCAAAC TTCAATTTCAAGAGAATGATGAGTTACACGTTCTCCTAACTGCAGACACT GTTGATCAATTGGATAAGGCGGAAGTGTTGGTTAGAGAGTTTTTAATACC AGTTGAGGAGGGTAAGAATGAACATAAACGTCAACAACTTCGTGAATTGG CTGAAATGAATGGTACACTTAGAGAACGTCCTGCTTACATGGGTAATCGT AGTTGGACACCTGTCGATATAAAATGTGTTCAATGTGGTGAAACTAGTCA TCCTTCCTCTGATTGTCCATTACGTTCGAATGAATCAAATCAACAATATA TCGAATCTGAATATCAAAAATTCATTGATGAAATGTCTAAATCTTTAGGT TTTGATATTAGTATTTCTCCAAATCAAAATGATAATTCTTTACAAAATAT AAATTTAAATAATAATAATAACAATAGTAATGGTAATAATAATGGAAATA ATAATGGACGTAATTTTAATAATGATACTGTTGGTGATATGGATGAATCA CCTCCACATCATACTCAATCACACTTTCAACAAAATTCACCTCAATTTGA TCAACAACAACACCAACAACAATGGAATAATAATAACAATAACAACAACA ATAACAATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT AATAATAATAATAATAATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAACTT TTCAAATTATAATAATAATAATCAATCTTTTTACAATAATAATAACTCAC CATATGGCCCTCCAAATGGTGGTTCTCCTTATGGTCCACCAAGAAATACG TACTAA >DDB_G0293876 sf3a2, ATGTCAGAATATGGTAAAGCAGGTAGTGGTGGTTTACAAAGTTCACAATA TGATAATATAGATAGAAGAGAAAGACAAAAACAATTAGTATTAGAACATG TTGATGTTTCAAAAGATCCATATATTATTTCAAATCATATAGGTTCTTTC GAATGTAGATTATGTTTAACAGTTCATAATAATGTTGGAAATTATTTAGC ACATACACAAGGAAAAAAACATCAAACTCATTTAGCACGTCGTGCTGCAA AAGAACAAAGAGAAAATCCATCTGTTTCAAAAAATAATTATATTCAAACA ACAAGAGTTATACATAAAAAAACAATTAAAATTGGAAGACCAGGTTATAA GATAATAAAACAAAGAGATTCAAAAACTGGTCAATTAAGTTTACTTTTTC AAATTGATTATCCAGAGATTGAATCTGGATTACAACCAAGACATAGAATT ATGTCTGCATTTGAACAAAGAGTTGAACAACCAAATAAAGATTATCAATA TTTATTATTCGCAGCAGAACCTTATGAAACTATAGCATTCAAAATACCAA ATAAAGAAATTGATAGGACTACTGGTCCTGACGGTAAATTCTTTACTCAT TGGGATAGGAATAAAACTTTTACTTTACAATTATATTTTAAAGAATAA >DDB_G0270020 sf3a3, subunit of the splicing factor SF3A required for spliceosome assembly contains PRP9 domain characteristic of splicing factor 3A subunit 3 expressed in pstO cells ATGTCATCATCATTACTAGAAAAGACTAGAAATTTACATGAGAATTTTGA AAGATATGAATTATTAATTGAAAATGAAATGAAAACAGAACCTAAAACAA CTAAAGAAAGAGTACTTCAAAGTCATAGAGTTAATCATTATTTAAATTCT TCAATTGAATGTTCAAAATCATTAATAAATATATATACAGATTCTGATCA TTCAAGAAAAGATGAATTAACATCAATTTCAGGATTTGGTACAGATTTAT ATAGTTCATTCTATGAAAAATTAAGAGAAATTAAAGATTATCATCGTAAA TTTCCAAATTTAAAAGAAGAAAGAAATAATGAACCTTTAATTTTTACTCC ATCAATTTCATTTACAGGTAATGAAATGAATGGTAAATTTTTAGATTTAA ATGAAAATTATGAAAAGTATATAAATTTATCATTTAATAGAAATAAATCA ATCAATTTAGATTATTTAACATATTTAACAAGTTATTATAAATTTCAATA TAATGATATCAATCGTATGAAATCTCCACAATATAAGGATTATTTAGAAT CAGTTTATAAATATTTAATTCATTTCATTGAAAGAACTCAACCATTATTT GAATTACAATCTTCAATAACTAAATCAGAGAATGAATTTATTGAAAAATG GAATAATAATGAATTTGATCCAATTGAAAATAATAATAATAATAACAATA ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAG TAATGTAAATAGTAATAATAACCAAGATGATAAATTATTTTGTAAAGCGT GTAAAAAATTATTTACTTCTGAAAATGTTTTTAATGGTCATTTAAAAGGT AAAAAGCATATACAAAATGAAGAAAAAATGAATACTAATAAAGATAATAA AGATGGTGATAGTAATAATAATAATAATAATAATAATGAAAAATGGTATA ATAAATTAAAATCAAGAAAAGATAATACAATGTTTGAATATAAAATTAAT AGATTATCAGAATATTTATCGGATCAGATTGAATCAACTAAAGAGAATGT TTTAAAGAAACAATCAAGAAGTTATACAGAGGTTGTTGATGGTGTTATGG TTGGTGGTGTGGGTGATGATGAGGAAGAGGATGAGGAGGTGAATATTGAT GATTTGGAAGTAGATGTTGAAGTTTCAAAATTAAAGATTGCAAATTATCC AGTAGATTGGAGTGGTAAACCAATTCCATATTGGGTTTATCGTTATTTAG AACTTGGTGTAGAATATAAATGTGAAATCTGTGGTAATCAATCTTACTGG GGTAGAAAGGCTTATGAAAAACATTTCCAAGAGACAAGACATTCCTATGG TATGTCAAGTATTGGTGTACCAAATACAACTCATTTTCATGAAATCACTA AAATTAAAGATGCCCTCGAACTTTGGTCAAAAATTAAAAATCAAACAAAT CAACAACAATTTAAATCTGATCGTGATGAAGAATATGAAGATGAAACTGG TAATGTTATGAGTAAAAAGAATTATGATCTTTTAGTTAAACAAGGTATTA TTAATCCAAATCAAAAGAAACGTTCTCATTATTAA >DDB_G0275957 sf3b1, ATGTCAGATCAACAAGATCAAACAATGTCAGAATGGGATGACACAACATT AAATAAAGCAAAAGTTGTTGAAGCAACACCAAGAAGAAATAGGTGGGATG AAACACCAGTAAGTAAACCAAGTACAGGTGTAGAGGAAACACCAAAAAGA AGATCAAGATGGGATGAAACACCAATAAATATAAATAGTGGAGGATTGAG TGGTGGAGTTACACCAAATTATAATGCAATGAGTAATGGTGGTGTAACAC CAATTTTTAATAATATGATGGATGGTGGTGTTACACCAGTATATAATAGT AATAATAACAACAACAGCAATAGCAATGGTGGTAGTAATAATAATAAAAA TATATTAATGCAAACACCAGATCCATATCAAGCACAATTACAAAAAGAGA TTGACGAAAGAAATAGACCATGGACAGATGAGGAATTGGATAATATATTA CCATCGGAAGGATACGAAATTTTACAACCACCAGCAAATTATCAACCAGT TATAGCAAGTAAAAAACTTACAGCAAGCACACCAATTGGTGCTGCAGGTA CAAGTGGTGGATTTTTCATACAGGAGGAGCAAAGTAGGGGTCAAGATTTT GGTATCATTGATGCACCCGATGGTATCACAATTAAACCAGAGGATAAGGT TTACTTTGAAAAGATTTTACAAGAGGGTGGTGATAATGATGAACATCTCT CACCAGAGGAGCAAAAGGAGAGAAGAATTATGAAACTATTATTAAGAATT AAGAATGGTACACCACCAATGCGTAAACAAGCTTTAAGACAATTGACTGA 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TTGAAATTGCAAATAAAGTTGGTGGTGGTGAAATTATTGAAAGAATTGTT GATGATCTTAAAGATGAATCCGAAGCCTATAGAAGAATGGTAATGGAGGC AATTGAAAAGATAGTTTCAACATTGGGTGCATCGGATATTAGTCCAACAT TGGAGGAGAGATTAATCGATGGTATTCTCTATGCATTCCAAGAACAAACC ACCGATGAAACTTCAATTATGTTACAAGGTTTTGGTACTGTTGTATTGGC TTTGAATACTCGTATTCAACCTTATCTTCAACAAATCGCTGGTACCATTA AATGGAGACTCAATAATAAATCTGCAAAGGTTAGACAACAAGCAGCCGAT TTAATCTCACGTATTGCTGTGGTTATGATGAATTGTGGTGAAGAGCAACT CTTGTCACATTTGGGTCAAATTCTTTATGAATATTTAGGTGAAGAGTATC CAGAGGTATTGGGTTCAATCCTAGGTGCATTGAAGGCCATTGTAAATGTA ATTGGTATGACTAAGATGACACCACCCATCAAAGATCTTTTACCACGTTT AACACCAATTTTAAAGAATCGTCATGAGAAAGTTCAAGAGAATTGTATCG ATTTGGTGGGTCGTATTGCCGATCGTGGTTCTGATTTCGTTTCAGACAGA GAGGGTATGCGTATTTGTTTCGAACTTTTAGATATGTTGAAAGCTCATAA AAAAGGTATTCGTCGTGCCGCTGTAAATACATTTGGTTACATTGCAAAAG CTATTGGTCCTCAAGAGGTATTGGCAACCCTATTAAACAATTTGAAAGTT CAAGATCGTCAAAACAGAGTTTGTACAACCGTTGCCATTGCCATTGTTGC GGAAACTTGTGCACCTTATACCGTTTTACCAGGTCTAATCAATGAATATC GTATTCCAGAGTTGAATGTTCAAAATGGTGTTTTGAAATCTTTATCTTTC CTCTTTGAATATATTGGCGAAATGGGTAAAGACTATATTTACGCCGTAAC TACCCTACTCGAAGATGCACTCATGGATAGAGATGCTGTACATCGTCAAA CCGCTTGCTCTGCAATTAAACATATTTCATTGGGTGTAATGGGTTTAGGT TGTGAAGATTCACTCACTCATTTACTCAATTACGTTTGGCCAAATGTTTT CGAAACTTCTCCACATGTTATCAACGCTTTCTTAGAGGCCGTTGAAGGTT TACGTTTTGCTTTAGGTCCAAATACTATTCTTCAATATACCCTTCAAGGT TTATTCCATCCATCTCGTAAAGTTAGAAATATTTATTGGAAACTTTATAA TATGCTTTATATTAGTTCTCAAGATGCTTTAACACCATGTTATCCAAGAA CTTTAGATGAAAATGATAATAAATATCAAAGATATGAACTTGATTTTGTA ATTTAA >DDB_G0284555 sf3b2, ATGGATACGACATTAACTGAAACTATCCAAAATAACAATAATATTAATAA ATCAATAAATAATAAAAAAAAATTAAAACATCAAAAGAAAAAAGAACAAA AAAAGAAACAAAAACAACAAAAAAAAGAAGAGAATATATTTCAACAAACT AATAATAATAATATAAAAGAAGAAATAAAACTTGAAAATAATGATGAAAA TAATGATGAAAATAATAATAATAATGATGATGATAAAATAACAGCACCAA TTGATGGATTTTCAATTGATGAGAATGATCCATCATTTGAATTATTTTCG AAATTAGTTAAACATTTTGATAACCCATATGAAGATCCAAAAGAGATTGA GAGAAAAGAACAAGAAGAACAAGAAGAAAAAGAAAGAAAAGAAAGAGAGG AAGAAGAAGAAAGAAAGAAAAAAGAAGATAATGAAGACGATGATGATGAT AATAACGATGATGATGATAATAATAATGATAATGAAGACGAGGATTCAAA 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TGGTCCAGAGAATCCAGGTGAAGGTGAACATAAAATTATTGATTACATTC GTAAAAACAAAGCTAGTCCAGATTGGGATGCCAACCAATCACATTGCTTA TATGGTTTAGATGCAGATTTAATTTTATTAGGATTAATTACACATGAACC AAATTTTTCAATTCTTAGAGAGGAGATATCATTTAAGCCAACCAAGAGAC AGTTAGATTTTCAATTACTTCACATATCATTATTACGTGAATATCTTGAC TTGGAGTTAAGAAATGATGATTTAGAGTTTGGATATGATTTAGAGAGAAT CATAGATGATTTCATATTGATTATGATATTTTTTGGTAATGATTTCTTAC CACATTTACCATTTTTAGAGATTTCAAAAGGTGGTCTAAACTCAATATTC GAATTGTATAAGAGTAGTCTTCCATCGTTGGGTGGTTACTTGACAGAGGG CGCCACAATCGATTTGGAAAGATTACAACATTTCTTCAAGTTTTTACAAA AATTCGAAAAGAAACAACAACAAGGAATTATGGGTTCAACTGAAGAGGAT TTAGATGATAAGAAGGTGGAAGTCGCAGAATTGGTAGAAGATTCAGTTTT AGAACATGATGGATTAGATGAAGAGGCAAAGAAAGAATTTGAAAGATTAG CAATGGAAAGATTAAAAAGTCATTTCCCAGTTTCTGATAGTGAAGATGGA GAAGAAGATCCTGATGAACAATTGGTTAACGAATTATATAATGTAGAAAA CTCTTATTATAGACAATATTTTAACGAATTCCCAAATACATTGGATGAGA TTAAAGCATTTAAAGAGAAAGTTGTATTATCCTATGTCGAAGGTTTAGTT TGGGTATTGAATTACTATCACAACGGTTGTATCTCTTGGGTTTGGTTCTA TCCATTCTACTATGCACCATTGGCAATCGATTTCAACAATATACCAGATT 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ATGGGTATTCCAGCTTTTTTTAGATGGTTAATTGATAAATATGGAGGATT AATTCAAGAAACAACTGAACCAAGAGAAGCAGATGGTGGTAGAAGTGTAG TTGATTTCACAACACCGAATCCAAATGGAGAGTATGATAATCTATATTTA GATATGAATGGTATTATACATCCTTGTGCACATCCAGAGAAGGGACCAAA GCCTAAATCAATTGAAGATATGATTCAATCGATCTATGAATATTTGGATC TACTCTTTGCAATTATACGTCCAAGAAAGTTAATTTATATGGCAGTTGAT GGTGTTGCACCAAGAGCAAAAATGAATCAACAACGTACTCGTAGATTTAG AGCTGCATTAGACTCACGTTTAGATAAAGATAAAGAAGCAGCATTATGGC GTGAAAGAATTTACGATGGTCTCGCAACTCAACAAGAATACGAACAATAT ATGGAAGAGAAGAAAAATAAATTCAAATTCGATTCAAATTGTATCACTCC AGGTACTTTATTTATGGATAGAGTTGCTGAATCTTTAAGAACTTATGTAG CTGAAAAATTAACAACTGATCCAGCTTGGAAAGATGTTAAAATTATAATT TCAGATGCAAGTGTACCAGGTGAAGGTGAACATAAGATTATGGATTATGT TAGACATCAAAGAGCACAACCAGATTATGATCCAAATTTAAAACATATTA TTTATGGTTTAGATGCAGATTTAATTATGTTAGGTTTAGCAACACATGAA GTTAATTTCGATATTTTAAGAGAGTTTATTCAACCAATTGCACGTGGTGT TTGTCATAAATGTCACAAGAAAGGTCATTTAGCAATTGAATGCAAGGAGG AGGTCGATGATAGTGTTAAGGATTTCCTTGTGAAAAATTATCAAATTCTT CATTTACATCTATTGAAAGAGTATTTAGAATTAGAGACAAAGGTGTCAAC 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catalyzes the conversion of 3'-phosphate to a 2'3'-cyclic phosphodiester at the end of RNA ATGACTAAAACTAAAAGAAATTTCAAACCACATAATAAAAAGACAAAAGT TCCTCAAGCACCAGCAACTAGCTCAACAAATTCAAAGGATGATAGTAGTT TACCAGAGGTAGAAGTCAATCCTTCGTTCGTTTTAGATGGATCGATTTTA GAAGGTGGAGGTCAGATTCTCAGAAACTCAATTGCTCTATCATCGCTATT GAGCAAACCAGTGAGAATCGAAAAGATCAGATACAACCGTGATCAACCCG GACTGAAAGCACAACACAAAGCCGGTGTCGATTTGGTGTCACGTATGTTC AAAGCACACACCGATGGCGTCAAACAAGGTTCAACAGTGCTCTACTATCA CCCGAGAATCTCAACCACCAATATCAAAGACCAGTCGATCGAGGCTGACA CTGGCACCGCTGGAAGTATCACATTACTCATTCAGATTGCATTGCCATGT TTGCTATTCACACCGAAATCAACAAAGCTTGATCTTGGCGGTGGAACCAA CGTTGACTTTTCACCGGCTGCCGACTACCTAATGAATGTATTCTTCCCAA TAGCCAAACAATTTGGTATCAATTCAAATATGGAAGTTTTAAAAAGAGGA TACTATCCAAGAGGAGGTGGAAAAGTATCGTTGATTACTCAACCAATTAA AGGTACACTCAATCCCATTTCCATTCTGAAAAAAGGAAACCTTGTAAAGT TCACAATTAGAGTATTTTTTACCTCAACAAGAATTTCAGCAGAGGTTGGC GATCGAATGTTGAATGCAGCAAGAAAAATGATAAAGAAAGATTATAAAAA AGTTGAAATCGTCGAGGAGTTGGTTGATACTGCTAAATATACATTTGGTG ATGGTTGTTGTATTTTTATTACTGCAGAAACAGATACAGGATGTTTGTAT GGTGGCTCTGCAAATGGAGCTATAGGTGTACCTGCTGAAAAGGTAGGAGA GGATGCAGCCACTTCAATATTAAATGATTTACTACATGGCGGATGTATGG ATGAGTATTTACAAGATCAATTGATTATCTTTATGGCTTTAGCAAAAGGT ACCAGTCAGATCAAAACCGGACCAATCTCACTTCACACAGAAACTTCTAT TCATTTCACATCTCTACTGACAGGAGCAAAATTCCAAGTTAAACCAGCAG AAGATAAACAAAGAGGTGAAGATACATTTATTATTACTTGTGAAGGTGTT GGATTTGAAAATAAATCATCTGAAACAAAGAGTGATGAGGAAATTACAGA ACAAAATGGAAATGATGATAATACTTCAACAACAACAACTACAACAACAT CTTCATCATCGTAG
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